基质栽培也是无土栽培的主要形式之一，基质栽培的方法也比较多，目前国内是以复合基质的槽式和袋式栽培为主的，其中岩棉栽培在一些农业科技领域内也有应用，但是一直发展不起来，应用范围并不广阔。由于无土栽培的种植条件比较高，也比较复杂，因此对于设施环境的调控也更加的严格。
对设施条件的要求
1.根部温度管理
作物根系生长和吸收养分的适宜温度一般在18～25℃之间，冬季当室温降到15℃左右时，基质中的温度也降到13～15℃，由于根系生长并不需要温差，温度过低很快影响根系活力，导致植株生长缓慢和叶片黄化;夏天当室温达35℃甚至更高时，基质中的温度就会超过30℃，引起根系呼吸过于旺盛而缺氧，并迅速引起根系和植株茎叶的衰老。
所以，基质栽培护根容器的保温隔热性就显得非常重要。因为基质容积小，温度变化大，没有土壤那么稳定。冬季低温和夏季高温季节都应采取保温隔热措施，冬季还应配合基质加温措施，以确保根部基质温度最低不低于16℃，最高不要超过28℃。
2.基质隔离保护
基质栽培为了提高保水、保肥能力，一般都应有保护基质和根系的容器，槽式及沟式培也必须用薄膜隔离土壤，以免根系扎入土中和引起水肥渗漏。但为了防止根部积水，底部需要保留少量排液孔，还要考虑废液的回收利用，以免造成地下水的******盐污染。
基质表面不覆盖(保湿)，夏秋高温季节很容易引起表面的盐分积累和引起藻类滋生，进而引起根部透气不良。有机生态型无土栽培和常规敞开槽式基质栽培都存在盐分积累问题，应该采用具隔热并保湿的材料覆盖根基表面。
3.供液设施
基质栽培一般都采用滴灌供液，由于北方水质钙镁离子含量高，加上营养液本身的多种矿物质离子的存在，生产上容易出现滴灌设施堵塞现象，尤其是微孔滴管设施，堵塞的频率就更高。
选用内径为0.8～1.2mm的发丝管剪成长度30～50cm，按每株苗1～2根布置插入供液支管上，靠近水源的发丝管宜长些，远处可短些，以协调供液的均匀性，在主管道上还必须配置80～120目的管道过滤器。供水或供液应掌握少量多次的原则，要保持滴孔湿润不干燥，以免结垢堵塞。
无土栽培相对于有土栽培的优点有很多，既能够节省土地资源，又可以不受环境的-，一年四季都可以种植，方便简单，因此以后的市场也会逐渐的朝向无土栽培方向发展，这在未来也是一个新的趋势。